Odata cu declararea Rezervatiei Biosferei Delta Dunarii (1990) a fost înfiintata si institutia pentru administrarea patrimoniului natural din domeniul public de interes national al Rezervatiei, precum si pentru refacerea si protectia unitatilor fizico-geografice de pe teritoriul RBDD – Administratia Rezervatiei Biosferei Delta Dunarii (ARBDD).
Administrarea Rezervatiei Biosferei Delta Dunarii este un proces complex si se deosebeste de administrarea publica ce se exercita în unitatile administrative din perimetrul rezervatiei cu care conlucreaza. Pe teritoriul rezervatiei se disting terenuri apartinând domeniului public de interes national, terenuri apartinând domeniului public de interes judetean, si local, precum si terenuri apartinând domeniului privat. Acestea sunt incluse în cele 8 unitati administrative din rezervatie, 7 comune si un oras (Sulina).